Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DTX4Q9Y2E6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DTX4Q9Y2E6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms