Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPCAL4Q9UM19 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPCAL4Q9UM19 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms