Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRNDQ9UKY0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRNDQ9UKY0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms