Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSL6Q9UKU0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSL6Q9UKU0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSL6Q9UKU0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms