Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPUSD1Q9UJJ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPUSD1Q9UJJ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPUSD1Q9UJJ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPUSD1Q9UJJ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPUSD1Q9UJJ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPUSD1Q9UJJ7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPUSD1Q9UJJ7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms