Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
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