Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK13-1Q9NX77 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms