Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms