Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PFDN5Q99471 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms