Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STAMBPL1Q96FJ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STAMBPL1Q96FJ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms