Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPTQ96BT3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPTQ96BT3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms