Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MCOLN3Q8TDD5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCOLN3Q8TDD5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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