Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDXQ7Z353 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDXQ7Z353 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDXQ7Z353 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms