Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms