Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC39A4Q6P5W5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A4Q6P5W5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.4 ms