Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL13AP3Q6NVV1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL13AP3Q6NVV1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.6 ms