Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NHLRC3Q5JS37 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms