Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC93Q567U6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC93Q567U6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC93Q567U6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms