Protein–RNA interactions for Protein: Q15053

KIAA0040, Uncharacterized protein KIAA0040, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0040Q15053 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.29■■□□□ 1
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KIAA0040Q15053 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0040Q15053 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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KIAA0040Q15053 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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KIAA0040Q15053 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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KIAA0040Q15053 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA0040Q15053 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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