Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUNX2Q13950 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RUNX2Q13950 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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