Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSPB3Q12988 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSPB3Q12988 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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