Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE3AQ05086 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE3AQ05086 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms