Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POU5F1Q01860 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU5F1Q01860 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU5F1Q01860 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU5F1Q01860 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU5F1Q01860 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU5F1Q01860 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU5F1Q01860 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POU5F1Q01860 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POU5F1Q01860 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POU5F1Q01860 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms