Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS1P54277 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS1P54277 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS1P54277 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS1P54277 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS1P54277 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS1P54277 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS1P54277 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS1P54277 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS1P54277 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS1P54277 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS1P54277 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS1P54277 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS1P54277 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS1P54277 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS1P54277 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS1P54277 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS1P54277 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS1P54277 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS1P54277 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS1P54277 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS1P54277 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS1P54277 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS1P54277 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS1P54277 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS1P54277 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS1P54277 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS1P54277 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS1P54277 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS1P54277 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PMS1P54277 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMS1P54277 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMS1P54277 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMS1P54277 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMS1P54277 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMS1P54277 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMS1P54277 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMS1P54277 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS1P54277 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS1P54277 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms