Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC18A1P54219 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A1P54219 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms