Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24CP53992 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms