Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A3P48751 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A3P48751 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms