Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA3P42263 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA3P42263 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms