Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH5P33151 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH5P33151 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH5P33151 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH5P33151 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH5P33151 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH5P33151 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH5P33151 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH5P33151 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH5P33151 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH5P33151 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH5P33151 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH5P33151 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH5P33151 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH5P33151 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH5P33151 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH5P33151 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH5P33151 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH5P33151 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH5P33151 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH5P33151 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH5P33151 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH5P33151 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH5P33151 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH5P33151 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH5P33151 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH5P33151 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH5P33151 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH5P33151 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH5P33151 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH5P33151 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH5P33151 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH5P33151 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH5P33151 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH5P33151 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH5P33151 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH5P33151 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH5P33151 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH5P33151 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH5P33151 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH5P33151 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH5P33151 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH5P33151 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH5P33151 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH5P33151 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms