Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC5P28715 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC5P28715 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms