Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO2P25791 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO2P25791 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO2P25791 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO2P25791 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO2P25791 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO2P25791 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO2P25791 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO2P25791 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO2P25791 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO2P25791 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO2P25791 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO2P25791 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO2P25791 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO2P25791 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO2P25791 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO2P25791 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO2P25791 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO2P25791 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO2P25791 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO2P25791 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO2P25791 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMO2P25791 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMO2P25791 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO2P25791 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO2P25791 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO2P25791 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO2P25791 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO2P25791 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO2P25791 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO2P25791 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO2P25791 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO2P25791 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO2P25791 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO2P25791 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO2P25791 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO2P25791 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO2P25791 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO2P25791 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO2P25791 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO2P25791 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO2P25791 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO2P25791 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO2P25791 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO2P25791 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO2P25791 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO2P25791 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO2P25791 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO2P25791 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO2P25791 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO2P25791 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO2P25791 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO2P25791 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO2P25791 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO2P25791 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO2P25791 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO2P25791 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO2P25791 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO2P25791 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO2P25791 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO2P25791 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO2P25791 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO2P25791 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO2P25791 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms