Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAK1P23458 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAK1P23458 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAK1P23458 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAK1P23458 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAK1P23458 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAK1P23458 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
JAK1P23458 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
JAK1P23458 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
JAK1P23458 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
JAK1P23458 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
JAK1P23458 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAK1P23458 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAK1P23458 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAK1P23458 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAK1P23458 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAK1P23458 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAK1P23458 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAK1P23458 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAK1P23458 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAK1P23458 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAK1P23458 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAK1P23458 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAK1P23458 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAK1P23458 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAK1P23458 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAK1P23458 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAK1P23458 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAK1P23458 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAK1P23458 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAK1P23458 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAK1P23458 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
JAK1P23458 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAK1P23458 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAK1P23458 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAK1P23458 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAK1P23458 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
JAK1P23458 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAK1P23458 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAK1P23458 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAK1P23458 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAK1P23458 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAK1P23458 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAK1P23458 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAK1P23458 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAK1P23458 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAK1P23458 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAK1P23458 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAK1P23458 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAK1P23458 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAK1P23458 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAK1P23458 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAK1P23458 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAK1P23458 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAK1P23458 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAK1P23458 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAK1P23458 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
JAK1P23458 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAK1P23458 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JAK1P23458 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JAK1P23458 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms