Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAD21O60216 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD21O60216 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD21O60216 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD21O60216 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD21O60216 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD21O60216 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD21O60216 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAD21O60216 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RAD21O60216 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD21O60216 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD21O60216 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD21O60216 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD21O60216 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAD21O60216 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAD21O60216 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD21O60216 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD21O60216 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD21O60216 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD21O60216 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD21O60216 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD21O60216 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD21O60216 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD21O60216 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD21O60216 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD21O60216 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD21O60216 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD21O60216 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD21O60216 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD21O60216 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD21O60216 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD21O60216 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD21O60216 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD21O60216 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD21O60216 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD21O60216 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD21O60216 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD21O60216 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD21O60216 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD21O60216 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD21O60216 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD21O60216 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD21O60216 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD21O60216 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD21O60216 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD21O60216 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD21O60216 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD21O60216 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD21O60216 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD21O60216 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD21O60216 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD21O60216 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD21O60216 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD21O60216 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD21O60216 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD21O60216 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD21O60216 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD21O60216 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD21O60216 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD21O60216 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms