Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRNO43815 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRNO43815 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRNO43815 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRNO43815 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRNO43815 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRNO43815 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRNO43815 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRNO43815 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRNO43815 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRNO43815 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRNO43815 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRNO43815 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRNO43815 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRNO43815 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRNO43815 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRNO43815 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRNO43815 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRNO43815 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRNO43815 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRNO43815 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRNO43815 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRNO43815 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRNO43815 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRNO43815 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRNO43815 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRNO43815 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRNO43815 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRNO43815 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRNO43815 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRNO43815 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRNO43815 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRNO43815 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRNO43815 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRNO43815 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRNO43815 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRNO43815 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRNO43815 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRNO43815 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRNO43815 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
STRNO43815 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRNO43815 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRNO43815 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRNO43815 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRNO43815 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRNO43815 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRNO43815 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRNO43815 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRNO43815 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRNO43815 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRNO43815 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRNO43815 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRNO43815 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRNO43815 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRNO43815 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRNO43815 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRNO43815 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRNO43815 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRNO43815 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRNO43815 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRNO43815 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRNO43815 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRNO43815 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRNO43815 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRNO43815 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRNO43815 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRNO43815 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRNO43815 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRNO43815 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRNO43815 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRNO43815 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRNO43815 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRNO43815 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRNO43815 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRNO43815 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRNO43815 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRNO43815 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRNO43815 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRNO43815 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STRNO43815 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRNO43815 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRNO43815 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRNO43815 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRNO43815 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRNO43815 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRNO43815 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRNO43815 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRNO43815 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms