Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDB2O43679 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LDB2O43679 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LDB2O43679 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDB2O43679 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDB2O43679 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDB2O43679 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDB2O43679 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDB2O43679 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LDB2O43679 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDB2O43679 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDB2O43679 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDB2O43679 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDB2O43679 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDB2O43679 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDB2O43679 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LDB2O43679 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LDB2O43679 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LDB2O43679 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LDB2O43679 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LDB2O43679 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDB2O43679 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDB2O43679 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDB2O43679 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDB2O43679 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDB2O43679 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LDB2O43679 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDB2O43679 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDB2O43679 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDB2O43679 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LDB2O43679 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms