Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPIPA5E9PKD4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms