Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LYVE1Q9Y5Y7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms