Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E8

PCDHB15, Protocadherin beta-15, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB15Q9Y5E8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB15Q9Y5E8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB15Q9Y5E8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB15Q9Y5E8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB15Q9Y5E8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB15Q9Y5E8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB15Q9Y5E8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB15Q9Y5E8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB15Q9Y5E8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB15Q9Y5E8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB15Q9Y5E8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB15Q9Y5E8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB15Q9Y5E8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB15Q9Y5E8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB15Q9Y5E8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms