Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLF12Q9Y4X4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms