Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOP58Q9Y2X3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms