Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPUSD1Q9UJJ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPUSD1Q9UJJ7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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