Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA12Q9UI09 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms