Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPS25Q9BRG1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS25Q9BRG1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms