Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GORASP1Q9BQQ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GORASP1Q9BQQ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GORASP1Q9BQQ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 834.9 ms