Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA3CQ99985 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA3CQ99985 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms