Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERGIC2Q96RQ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC2Q96RQ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms