Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CNBD2Q96M20 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms