Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf48Q96LL4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf48Q96LL4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms