Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC34Q96HJ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC34Q96HJ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC34Q96HJ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms