Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX27Q96GQ7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX27Q96GQ7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX27Q96GQ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX27Q96GQ7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX27Q96GQ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX27Q96GQ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX27Q96GQ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX27Q96GQ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX27Q96GQ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX27Q96GQ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX27Q96GQ7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms